• Document: SURVEILLANCE SENTINELLE DES SYNDROMES GRIPPAUX ET DES INFECTIONS RESPIRATOIRES AIGUËS SEVERES AU NIGER
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REPUBLIQUE DU NIGER Ministère de la Santé Publique et de la Lutte Contre les Endémies Centre de Recherche Médicale et Sanitaire Etablissement Public à caractère Scientifique et Technique Réseau International des Instituts Pasteur 634 Bd de la Nation, YN034 – BP10887 Niamey – NIGER Tel: (227) 20 75 20 40 (227) 20 75 20 45 – Fax : (227) 20 75 31 80 – cermes@cermes.org ___________________________________________________________________ SURVEILLANCE SENTINELLE DES SYNDROMES GRIPPAUX ET DES INFECTIONS RESPIRATOIRES AIGUËS SEVERES AU NIGER Du 1er janvier au 30 novembre 2011 2 Rapport réalisé par :, Jean-François JUSOT1 Jean Marc COLLARD2 : relecture et responsable du laboratoire national de la grippe et de la validation des résultats d’analyse Avec la collaboration technique de Lagaré ADAMOU2, Ali SIDIKI1, Bibata SIDIKOU1, Bassira ISSAKA2, ALKASSOUM Bassira Nana2 Animation du réseau : Jean-François JUSOT1 et Lagaré ADAMOU2 Avec la collaboration externe de Epicentre 1. Unité d’Epidémiologie / Santé – Environnement - Climat 2. Unité de Biologie REMERCIEMENTS A tous les agents de santé des sites sentinelles qui ont activement participé à ce système de surveillance en envoyant au CERMES les prélèvements effectués pour leurs patients. A tout le personnel de la Direction des Affaires Administratives et Financières du CERMES. FINANCEMENTS POUR LA SURVEILLANCE ET LA CREATION DU LABORATOIRE Ministère de la Santé, de la Jeunesse et des Sports de la République Française / Réseau International des Instituts Pasteur Ministère des Affaires Etrangères de la République Française SANOFI-Pasteur CERMES, BP 10887, Niamey – Tel (+227) 20 75 20 40 – Fax (+227) 20 75 31 80 – mail cermes@cermes.org 3 LISTE DES ABREVIATIONS CERMES : Centre de Recherche Médicale et Sanitaire CHR : Centre Hospitalier Régional CNGE : Comité National de Gestion des Epidémies CNR : Centre National de Référence CTA : Centre de Traitement Ambulatoire CSI : Centre de Santé Intégré DMN : Direction de la Météorologie Nationale DSRE : Direction de la Surveillance et de la Riposte aux Epidémies FNIS : Forces Nigériennes d'Intervention et de Sécurité HD : Hôpital de District HN : Hôpital National ISG (ILI) : Infections Semblables à la Grippe IRAS (SARI) : Infections Respiratoires Aiguës Sévères LSB2 : Laboratoire de Sécurité Biologique MDO : Maladie à Déclaration Obligatoire Modèle SIR : Susceptible Infected Removed MSP: Ministère de la Santé Publique OMS : Organisation Mondiale de la Santé PCR : Polymerase Chain Reaction PSM de type II : Poste de Sécurité Microbiologique de type II CERMES, BP 10887, Niamey – Tel (+227) 20 75 20 40 – Fax (+227) 20 75 31 80 – mail cermes@cermes.org 4 RESUME 6 1. INTRODUCTION 8 2. DESCRIPTION DE LA SURVEILLANCE SENTINELLE 10 2.2. RAPPEL DE L'HISTORIQUE DU SYSTEME DE SURVEILLANCE SENTINELLE 10 2.2. FONCTIONNEMENT DU SYSTEME DE SURVEILLANCE SENTINELLE 11 2.2.1. Définition de cas 11 2.2.2. Collecte des échantillons et saisie des données épidémiologiques 12 2.2.3. Diffusion des résultats 12 2.3. METHODES D’IDENTIFICATION ET DE CARACTERISATION DES AGENTS BACTERIENS 13 2.3.1. Création d’un laboratoire pour le diagnostic moléculaire de la grippe 13 2.3.2. Fonctionnement du laboratoire 13 2.4.1. Analyse descriptive 14 2.4.2. Tests statistiques utilisés 14 3. Résultats 16 3.1. IDENTIFICATION ET CARACTERISATION DES CAS SELON L’AGENT ETIOLOGIQUE 16 3.1.1. Activité des sites

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